在论文查重中，引用阈值设置是指系统在检测文献中引用内容时所允许的最小匹配相似度。不同的引用阈值设置会对查重结果产生不同的影响。较高的引用阈值设置会导致更严格的匹配要求，可能漏检一些引用，而较低的引用阈值设置则可能导致误报。因此，合理设置引用阈值对于确保查重结果的准确性至关重要。

引用阈值设置还会影响到文献查重的速度和效率。较高的引用阈值会增加系统匹配的难度，可能导致查重速度变慢，但查重结果更加可靠。相反，较低的引用阈值虽然可以加快查重速度，但也容易出现误报情况。因此，在设置引用阈值时，需要综合考虑准确性和效率之间的平衡，选择适合自身需求的引用阈值。